糸ようじは毎日やった方が良いですか?

はい。歯と歯の間は通常の歯ブラシは届きにくく、汚れがたまりがちな部位です。寝る前に、もしくはお風呂に入りながらでも、1日1回の使用でプラークは激減するはずです。